CF

compsort for Mac

Forlegger: Paul A. Wilson
Mac Free
nedlasting v1.01 29 nedlastinger
Versjon1.01
Forlegger Paul A. Wilson
Utgivelsesdato25. aug. 2008
Dato lagt til11. aug. 2004
Os kravMacintosh, Mac OS X 10.3
KravMac OS X 10.3
Totalt antall nedlastinger29
PrisFree

Beskrivelse

Kommandolinjeverktøy for å sammenligne kommadelte datafiler ved å bruke relative forskjeller for å bestemme de mest like konformasjonene. Compsort sammenligner datafilene ved å bruke relativ forskjell, beregner en likhetspoeng, sorterer poengsummen i stigende rekkefølge (lavere verdier representerer større likhet), lagrer X antall lave poengsummer.

Datafilene produsert av brukeren må være kommadelte tekstfiler. Hver fil representerer et unikt molekyl. Hver rad i en fil representerer en unik konformasjon av molekylet. Den første kolonnen i datafilen må være en etikett som er unik for konformasjonen representert av raden. Resten av kolonnene er numeriske deskriptorer, for eksempel avstandsmålinger.

Radene sammenlignes kombinatorisk mellom filer. Etikettene i sammenligning er sammenkoblet og lagret med poengsummene for settet med rader. Dette gir en måte å identifisere konformasjonene som ga en gitt likhetspoeng.

Fremtidig arbeid inkluderer:

legge til GUI-grensesnitt

legge ut papir på min 3D farmakoformodelleringsalgoritme

En parallell versjon som bruker MPI

Lignende programmer

Alternativer

Mer fra denne utgiveren