CodonCode Aligner

Beskrivelse

CodonCode Aligner er brukervennlig programvare for DNA-sekvenssammenstilling, justering, contig-redigering og mutasjonsdeteksjon. Aligner er kompatibel med Phred-Phrap og støtter fullt ut sekvenskvalitetspoeng, samtidig som den tilbyr et kjent brukergrensesnitt som er lett å lære. Funksjoner inkluderer import av sekvenser fra tekstfiler, juster contigs til hverandre samtidig som koblingene til sporene holdes, finne heterozygote mutasjoner, definere områder av interesse ("funksjoner"), importere og redigere Phrap-genererte sammenstillinger, eksportere sekvenser og funksjoner, importere sekvenser fra ABI- og SCF-filer, vektortrim, juster til en referansesekvens, analyser heterozygote innsettinger og slettinger, naviger mellom brukerdefinerte funksjoner og eksporter Consed-kompatible monteringsprosjekter.