InDelFixer

Beskrivelse

InDelFixer er java-program for å fjerne rammeskift som forårsaker innsettinger eller slettinger fra neste generasjons sekvenseringsdata. I noen tilfeller er det kjent at proteinet av interesse ikke har noen varianter med rammeskift. Disse rammeskiftene kan korrigeres med et gitt referansegenom (eller multippel justering i en fremtidig versjon). Programmet godtar standard flyt gram-formaterte filer, FASTA/PacBio ccs-filer og Illumina-parede sluttdata som FASTQ-filer.