| Versjon | 2.0.1 |
|---|---|
| Forlegger | Dhirendra Kumar |
| Utgivelsesdato | 2. mai 2013 |
| Dato lagt til | 2. mai 2013 |
| Os krav | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Krav | None |
| Totalt antall nedlastinger | 22 |
| Pris | Free |
Beskrivelse
GenoSuite er et rammeverk utviklet for proteogenomisk analyse. FDRScore-basert strategi brukes til å integrere resultater fra flere søkealgoritmer. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) er utviklet som en del av GenoSuite-rammeverket. PPT er for å finne nye oversettelser i prokaryote genomer og er avhengig av massespektrometribaserte proteomikkdata og relatert genomsekvens. Funksjonene inkluderer konfigurert for 4 åpen kildekode-algoritmer for å utføre databasesøk for peptididentifikasjon, og en hvilken som helst kombinasjon av de 4 algoritmene kan velges, lister opp genomsøkespesifikke peptider (novel peptider), spektrale treff kan visualiseres for kvalitetsvurderingen, lister ut de nye proteinene og endringer i de eksisterende proteinkommentarene, og en visuell genomisk kontekst av de nye peptidene kan også genereres.
