Ascalaph Designer

Beskrivelse

Ascalaph Designer er et generell program for molekylær dynamiske simuleringer. Under et enkelt grafisk miljø er representert som deres egen implementering av molekylær dynamikk så vel som metodene for klassisk og kvantemekanikk av populære programmer. Funksjoner inkluderer molekylær grafikk: flere vinduer, to kameraer per modell, CPK, Wire frame, Stick, Ball and Stick, og CPK Wire rammestiler, molekylær modellbygging: krystallbygger, kjedebygger, tegning med mus, redigering av molekylær geometri, foreløpig optimalisering , kvanteoptimalisering og fjerning av sammenstøt, molekylær geometrioptimalisering med konjugerte gradientmetoder, molekylær dynamikk: flertidstrinnsintegrasjon, fjerde ordens integrasjon, superdatamaskinberegninger ved hjelp av MDynaMix, fleksibel SPC-vannmodell og implisitt vannmodell, og kvantekjemi med hjelp av CP2K og PC GAMESS/Firefly: energi, molekylær geometrioptimalisering og potensielle avledede ladninger.