Pedimap

Beskrivelse

Pedimap er et verktøy for å utforske og visualisere flyten av fenotyper og alleler (observert eller basert på Identity-by-Descent-beregninger) gjennom stamtavler. Den har verktøy for manuell og automatisk valg av deler av stamtavlen basert på kriterier som forfedre og/eller avkom til et spesifisert antall generasjoner, langs mors-, fars- eller begge linjer, søsken osv. For hvert utvalg kan flere visninger vises generert for å vise forskjellige koblingsgrupper, fenotypiske egenskaper osv. Når en visning er opprettet for ett utvalg, kan den automatisk gjenskapes for et hvilket som helst annet utvalg. Pedimap kan håndtere numeriske så vel som tekstuelle fenotypiske skårer, og med polyploider så vel som diploider. Den genetiske informasjonen kan vises i henhold til genetiske koblingskart, derav navnet.