POY

Beskrivelse

POY er et fylogenetisk analyseprogram som støtter flere typer data (f.eks. morfologi, nukleotider, gener og genregioner, kromosomer og hele genomer). POY er spesielt ved at den kan utføre ekte justering og fylogeni-inferens, det vil si at inngangssekvenser ikke trenger å være forhåndsjustert. Innsettinger, slettinger og omorganiseringer kan deretter inkluderes i den samlede trepoengsummen under Maximum Parsimony, eller i modellen under Maximum Likelihood. En rekke heuristiske algoritmer er utviklet for dette formålet og er implementert i POY.