ImageSurfer

Beskrivelse

ImageSurfer er et gratis 3D-bildebehandlingsprogram for mikroskopi. Det lar etterforskere visualisere og analysere flerkanals 3D og 4D (time-lapse) volumer. ImageSurfer tilbyr flere verktøy for bildegjenoppretting, inkludert dekonvolusjonsalgoritmer (Wiener-filter, begrenset iterativ og maksimal sannsynlighet) for å fjerne uskarphet introdusert av bildesystemet. For visualisering gir ImageSurfer flere volum- og overflategjengelsesteknikker. Programvaren har også en nyskapende farget isosurface-modus som gir en kvalitativ visning av korrespondansen mellom to kanaler.

En "slice extractor" gjør det mulig for brukeren å undersøke et tverrsnitt av volumet tatt i enhver retning. Det fangede stykket kan visualiseres som et tradisjonelt 2D-bilde eller som en 3D-avlastningsrepresentasjon der bildeintensiteten er kodet som høyde. For ytterligere å undersøke romlig overlapping mellom strukturer, kan etterforskeren bruke data fra en annen kanal for å fargelegge 3D-relieffrepresentasjonen. For kvantifisering kan signalintensitetsverdier deretter samples i fangede skiver langs en brukerdefinert spline. I tillegg til å ta bilder av 3D-representasjoner og generere filmer, kan 3D-modeller også eksporteres som OBJ- eller VRML-filer (virtual reality modellering språk); VRML-filer kan vises i nettlesere ved hjelp av en gratis plugin-modul. Begge filtypene kan importeres til populære 3D-gjengivelsesprogrammer for videre behandling, og til Acrobat 3D for å produsere dokumenter som kan vises interaktivt med Adobe Reader 8.